вопрос вроде бы простой, но все же запрошу консультацию у сообщества)

Как вести учет: каждый раз разносить оплату с помощью документа "Взаимозачет задолженности"? Или как правильно действовать?

Если включить ФО "Независимо вести партнёров и контрагентов", то все равно каждый раз вводить "Взаимозачет задолженности"? Или что-то поменяется тогда в схеме?

что значит "реализация на разные КПП"? Разные плательщик, или плательщик всегда головной только грузите на разные обособленные?

(1) да, именно так как вы написали. "плательщик всегда головной только грузите на разные обособленные" верно

(2) тогда у вас и покупатель всегда один и тот же, только разные грузополучатели. Никакие взаимозачеты не требуются.

(3) действительно... сейчас еще раз пообщаюсь с оформителем отгрузок, может я не правильно его понял, или он не знал, что в реализации можно указать грузополучателя отличного от клиента...