Как можно фиксировать измененные товары, клиентов, цены, остатки. ЧТо б не выгружать все каждый раз. Может у кого есть опыт? Пока на ум приходит сделать справочник где фиксировать ссылку на товар, клиента при записи карточки или записи документа.

Настроить уриб, после обмена с сайтом чистить upds

(1) Не уриб, а план обмена

(2) в 1с 7.7?

Или проставлять Дату время до милисекунды в строку, что бы не удалять, и отбирать после последней времени последнего выгруженного документа

(3) В 7-ке тогда МОД наше всё

(4) А лучше номер транзакции

Если база SQL - то триггера, и спецтабличка изменённых объектов. Опыт есть.
Ну или как в (1)