автоматическое перепроведение в бухгалтерии 1с есть ли типовое решение?
Если нет посоветуйте как можно реализовать?

операции - проведение документов

не смотри что там написано "проведение"
на самом деле там  и перепроведение возможно..

атоматическое, например ночью

(3) Ещё уточнения будут? Давай уж все хотелки сразу выкладывай.
Планировщик, запуск внешней обработки "из-под" коммандной строки в которой пару строк для вызова "типового решения" :)

Где хранить внешнюю обработку, где посмотреть как запускать внешнюю обработку, что писать в батнике?

Где хранить? Да где угодно, куда право доступа есть у пользователя, запускающего эту обработку.
Как запускать? В поиске по Мисте посмотри "/Execute".
Что писать? Строка запуска 1С:Предприятия с параметрами.

(6) + рекомендую использовать параметр "/Out" и в обработке предусмотреть завершение работы по окончании перепроведения документов.